A tárlat tematikus egységei figyelemmel kísérik többek között Csontváry utazásait is, kalandozásai követéséhez térkép installáció is készült. A patikussegédből lett festőzseni különösen vonzódott a mediterrán és közel-keleti tájakhoz, a Szentföldön végzett alkotómunka hangsúlyos szerepet tölt be az életművet bemutató tárlaton. Más művek mellett többek között olyan klasszikusok is láthatók a tárlaton, mint A taorminai görög színház romjai, a libanoni Baalbek városának romjait megörökítő alkotás, vagy a mindenki által ismert a Magányos cédrus című 1907-ből származó olajfestménye. A két emeletnyi termekben továbbá egyéb tájképek, valamint ember- és állatábrázolások, egy önarckép is helyet kapott. A festmények mellett a Münchenben készített korai szénrajzok, illetve a közel tizenöt évvel későbbről származó ceruzagrafikák is megtekinthetőek. A kiállított művek többsége a pécsi Janus Pannonius Múzeumból érkezett, de számtalan alkotást kölcsönöztek a Magyar Nemzeti Galériából és miskolci kiállítóterekből is. A Csontváry-tárlatot Mispál Attila rendezte kisfilmrészletek kísérik, amelyek Varga József színművész, a Nemzeti Színház társulati tagja főszereplésével készültek.