A voksolás első fordulóját április 5-én, a másodikat június 14-én tartották. Abdulla Abdulla volt külügyminiszter és Asraf Gáni volt pénzügyminiszter jutott nyolc jelölt közül a második fordulóba. Abdulla Abdulla, aki az első menetben győzött, a másodikban viszont alulmaradt, a rendellenességek miatt nem fogadta el a végeredményt. Asraf Gáni is választási csalással vádolta a másik felet. John Kerry amerikai külügyminiszter közvetítése nyomán a két jelölt beleegyezett a voksok teljes újraszámlálásba. A július 17-én megkezdett újraszámlálás azonban rendkívül nehézkesen halad, noha a választási bizottság azt ígérte, három-négy hét alatt végeznek az auditálással. Összesen 23 ezer szavazóurnát kellett a fővárosba szállítani. Ezek közül mindössze kétezret ellenőriztek. Az újraszámlálás már négyszer elakadt, ezúttal a muszlim Eid ünnep miatt állt. Szombaton folytatódott volna, de Abdulla Abdulla megbízottjai nem jelentek meg, annak ellenére, hogy Kerry telefonon sürgette a két jelöltet, hogy tartsák magukat a megállapodáshoz. Az ENSZ afganisztáni különmegbízottja is aggodalmát fejezte ki a késlekedés miatt.
A Kerry által tető alá hozott megállapodás értelmében Afganisztánban nemzeti egységkormány alakulna, s a nyertes az államfői, a vesztes a kormányfői posztot töltené be. A végeredmény kihirdetése annál is sürgetőbb lenne, hiszen év végére befejeződik a nemzetközi stabilizációs erő, ISAF katonáinak kivonása Afganisztánból, s továbbra sem sikerült rendezni az országban maradó amerikai katonák státuszának kérdését. Washington mintegy tízezernyi katonát állomásoztatna Afganisztánban, ám csak akkor, ha aláírják a helyzetüket rendező egyezményt. Erre a továbbra is hivatalba lévő afgán elnök, Hamid Karzai nem volt hajlandó, utóda beiktatásának időpontja pedig jelenleg teljesen bizonytalan.