A szerdán nyilvánosságra hozott eredmény szerint a referendumon óriási többség, 86 százalék voksolt az önállóság mellett, ami 176 928 szavazatnak felel meg. Mindössze 3 043-an kívántak Pápua Új-Guineában maradni. Ezzel Bougainville válik a világ legfiatalabb országává. Az eredményt azonban az anyaország parlamentjének is ratifikálnia kell. A voksoláson azonban olyan elsöprő győzelmet arattak az elszakadáspártiak, hogy a Port Moresbyben székelő kormány aligha gördít akadályt a függetlenség kikiáltásának útjába.
A népszavazást felügyelő bizottság elnöke, Bertie Ahern volt ír kormányfő minden felet felszólított az eredmény tiszteletben tartására. Mint mondta, a referendum az első lépés volt afelé, hogy a sziget békében élhessen. A népszavazást egy 2001-es békemegállapodás tette lehetővé. A függetlenségi küzdelmekben mintegy 20 ezren haltak meg.