Ott helyezték el az afganisztáni tálibok és az al-Kaida ellen indított offenzíva során ejtett hadifoglyokat, terroristagyanús személyeket, a 9/11-es terrortámadások egyes kitervelőit. Valaha összesen 175 rabot tartottak a táborban, többségüket hosszú évekig, mindenféle bírói ítélet nélkül. Obama leköszönésekor már csak 26-an raboskodtak Guantánamón, köztük a 9/11-es terrorcsapás fő kiagyalója, Hálid Sejk Mohammed.
Trump azonban úgy gondolja, hogy a táborban tömérdek hely van a „rosszfiúknak”, s már kampányában megígérte, hogy ismét benépesíti a tábort. A NPR rádió értesülése alapján már beiktatása óta dolgozik egy rendeleten, amely jogi alapot teremt rabok új generációjának guantánamói elhelyezésére. Noha a rabok kínzását még a Bush-adminisztráció idejében megtiltották, s a kínzás határát súroló kihallgatási módszereket is törvényen kívül helyezték, Trump kampányában még amellett kardoskodott, hogy a vízbefojtásos kihallgatási technikát is vissza kellene állítani. Védelmi minisztere, valamint a CIA-főnök azonban egyaránt úgy nyilatkozott, nem helyeselnék a kínzás visszaállítását.