Az európai szövetség (UEFA) nyoni székházában tartott hétfői sorsoláson azonos nemzetbeliek és a korábban ugyanabban a négyesben szereplők nem kerülhettek össze. Az UEFA döntése nyomán a feszült politikai helyzet miatt orosz és ukrán csapatokat sem sorsoltak össze egymással. A 12 csoportelső és a négy Bajnokok Ligájából átkerült együttes kiemeltként várta a sorsolást.
A párosítások közül kiemelkedik a Villarreal és a Roma, a Manchester United és a St. Étienne, valamint a Borussia Mönchengladbach és a Fiorentina összecsapása.
A nyolcaddöntőbe kerülésért kiírt párharcok első mérkőzéseit február 16-án, a visszavágókat egy héttel később rendezik.
A sorozat fináléjának május 24-én a svédországi Solna ad majd otthont.
Az elmúlt három kiírás győztese, a Sevilla a Bajnokok Ligája nyolcaddöntőjébe jutott, így biztosan nem védi meg címét az Európa Ligában.
Párosítás a legjobb 32 között:
Athletic Bilbao (spanyol)-APOEL (ciprusi)
Legia Warszawa (lengyel)-Ajax Amsterdam (holland)
RSC Anderlecht (belga)-Zenit (orosz)
Astra (román)-Genk (belga)
Manchester United (angol)-St. Étienne (francia)
Villarreal (spanyol)-AS Roma (olasz)
Ludogorec (bolgár)-FC Köbenhavn (dán)
Celta Vigo (spanyol)-Sahtar Donyeck (ukrán)
Olimpiakosz (görög)-Osmanlispor (török)
Gent (belga)-Tottenham Hotspur (angol)
Rosztov (orosz)-Sparta Praha (cseh)
Krasznodar (orosz)-Fenerbahce (török)
Borussia Mönchengladbach (német)-Fiorentina (olasz)
AZ Alkmaar (holland)-Olympique Lyon (francia)
Hapoel Beer-Sheva (izraeli)-Besiktas (török)
PAOK (görög)-Schalke 04 (német)
Az EL további menetrendje:
legjobb 32:
első mérkőzések: 2017. február 16.
visszavágók: 2017. február 23.
nyolcaddöntő:
első mérkőzések: 2017. március 9.
visszavágók: 2017. március 16.
negyeddöntő:
első mérkőzések: 2017. április 13.
visszavágók: 2017. április 20.
elődöntő:
első mérkőzések: 2017. május 4.
visszavágók: 2017. május 11.
döntő:
2017. május 24., Solna