A szlovák elnökség prioritása a gazdasági és a monetáris unió elmélyítése, az energetikai unió és az egységes digitális piac erősítése, a fenntartható migrációs és menekültpolitika kialakítása, valamint a kereskedelem fejlesztése lesz, ismertette Lajčák a kormány terveit. A külügyminiszter szerint ezen belül is a legfontosabb prioritás az Európai Unió gazdasági erősítése.
„A pénzügyi területen az egyik kulcsfontosságú téma a kis- és középvállalkozások támogatása” – jelentette ki Lajčák. A pénzügyi terület egyik legfontosabb feladata az unió 2017-es költségvetésének az elfogadása. Ha ez nem sikerülne, akkor a 2017-es évet költségvetési provizóriummal kezdené az unió. A szlovák elnökség várhatóan tárgyalni fogja a jelenlegi hétéves költségvetési ciklus – 2014–2020 – eddig eltelt szakaszának értékelését is. A vita tétje, hogy mit finanszírozzon nagyobb mértékben az unió a hátralévő időszakban, és mit kevésbé, például több pénzt szánhat a menekültválság megoldásával kapcsolatos problémák megoldására.
A lakosságot a legjobban érdeklő téma mindenképpen a menekültválság lesz.