A felügyelet szerint Kelemen folyó bírósági ügyek kapcsán is kifejtette a véleményét, ezzel pedig RMDSZ-elnöki minőségében, és a parlament tagjaként nyomást gyakorolt az ügyekben eljáró ügyészekre és bírákra. A RMDSZ kongresszusán azt állította, hogy Nagy Zsolt volt távközlési miniszter ártatlanul ül börtönben, Markó Attila volt parlamenti képviselőt pedig azért ítélték el, mert - a sepsiszentgyörgyi Székely Mikó református kollégium visszaszolgáltatásakor - jóhiszeműen alkalmazta a törvényt.
A tanács februárban is elmarasztalta Kelemen Hunort egy hasonló kijelentés miatt. Akkor az RMDSZ megalakulásának a 25. évfordulója alkalmából tartott kolozsvári gálán azt állította, hogy Nagy Zsoltot ártatlanul ítélték el, ügye nem korrupciós ügy, az ellene felhozott vádakra nincsenek bizonyítékok mások lehallgatott beszélgetéseiből következtettek az ő állítólagos bűnösségére.
Részlet Kelemen Hunor kongresszusi beszédéből
"El kell tudnunk magyarázni, mi a különbség aközött, ha valaki közpénzeket magáncélra fordít és aközött, ha valaki az egyházi ingatlanok visszaszolgáltatásában jár el, vagy járulékos áldozata egy olyan ügynek, amihez semmi köze. Nagy Zsolt ma ártatlanul ül a börtönben. Nekünk pedig, a szolidaritás mellett az is dolgunk, hogy olyanná alakítsuk a jelenlegi törvénykezést, amely megakadályozza az ilyen méltánytalan eljárást. Veled vagyunk, Zsolt!"