A pápa a dél-olasz város északi részén található Scampia negyedbe is ellátogatott, amely híres bandaháborúiról. Később mintegy 60 ezer hívő jelenlétében misét mondott a nápolyi Piazza Plebiscitón, majd a Poggioreale börtönben együtt ebédelt 90 emberrel, egyebek mellett homoszexuálisokkal, HIV-vírussal fertőzött személyekkel. Látogatása során jelentős volt a rendőri jelenlét. Mintegy 3000-en ügyeltek testi épségére.
Első ízben fordult elő, hogy a pápa jelenlétében történjék meg Szent Januáriusz vércsodája. Nápoly érseke, Crescenzio Sepe a hagyományoknak megfelelően elővette a szent üvegtégelyben őrzött vérét, ami félig folyékonnyá vált. A pápa úgy tűnt, nem akar csodatévő szerepében tetszelegni, így kijelentette: „Úgy tűnik, a szent csak félig szeret bennünket.
Több jót kell tennünk, hogy még jobban szeressen minket.” Általában a május első vasárnapja előtti szombaton, illetve szeptember 19-én történik a csoda, és nyolc napon át tart. Ezután a vér ismét megalvad. A csodás jelenség bekövetkeztét a nápolyiak a következő hónapok kedvező vagy kedvezőtlen előjeleként értelmezik.