Palkovics Péter 2010 júniusától töltötte be az MVH elnöki tisztségét, amelyről 2014. szeptember 10-i hatállyal mondott le.
A közlemény szerint lemondását azzal indokolta, hogy az Európai Unió Közös Agrárpolitikájának (KAP) 2007-2013 közötti költségvetési ciklusa lezárult, és a 2014-es átmeneti év végének közeledtével az MVH, mint az agrár- és vidékfejlesztési támogatások kifizető ügynöksége végrehajtotta e programozási időszakra vonatkozó operatív feladatait. Az új, 2014-2020 közötti költségvetési és KAP programozási ciklus végrehajtása pedig a kifizető ügynökség szintjén teljesen elkülönülő, új szakmai feladat.
Palkovics Péter a továbbiakban a versenyszférában kívánja kamatoztatni szakértelmét.